Du scheinst ein Problem mit dem Ladeluftkühler zu haben?! Hast Du ihn gebraucht erworben, bei einem Händler oder...? War das bei der Probefahrt noch nicht so?
Der erste Fehler scheint ein Problem mit dem großen Turbo zu sein, eventuell hängt die VTG-Steuerung oder das Umschaltventil. Das kann mit einem Tester geprüft werden (alle Positionen von VTG und Umschaltventil werden manuell angefahren)
Der zweite Fehler dürfte die untere Kühlerjalousie sein, die geht gerne kaputt (ist bei mir aktuell auch hinüber, glücklicherweise steht sie dauerhaft offen, was erstmal keine negativen Auswirkungen hat - wird beim nächsten Service repariert). Welches Baujahr/Laufleistung hat dein 540d?
Allerdings sollte sich das Ruckeln beim Start eine andere Ursache haben - der Notlauf könnte aber von der Turboladerregelung & Jalousie kommen (Ladedruck passt nicht & Ladelufttemperatur zu hoch).
Mögliche weitere Ursachen gibts erstmal sehr viele. Allerdings würden viele auch einen Fehlereintrag generieren, momentan hast du ja nur die Kühlerjalousie drin stehen...
- Verkokung AGR / Ansaugbrücke
- Drosselklappe defekt (hatte ich vor kurzem, hat sich ebenfalls mit einem Ruckeln bemerkbar gemacht. Und ja, auch der Diesel hat eine!)
- Injektorfehler
Wenn du den 540d gerade erst erworben hast, wäre der Fall für mich sowieso klar: Zurück zum Händler und umgehend beheben lassen!
Ja, das wäre immer super, wenn du uns auf dem Laufenden hältst 
So ein Forum ist eine wichtige Wissensquelle für alle User. Vielleicht hat jemand irgendwann ein gleiches Problem und findet dank dir schnell eine Lösung.
Grundsätzlich aber erstmal:
1. Den verkaufenden Händler anrufen! In den ersten 6 Monaten ist ER in der Gewährleistungspflicht, ohne Wenn und Aber. Spreche mit ihm ab, welche Werkstatt sich um den Defekt kümmern soll, damit er die Rechnung trägt. Und nein, NICHT auf die Garantie (welche den Turbolader i.d.R. ausschließt) abwimmeln lassen! Alternativ soll er ein Lösungsangebot unterbreiten.
2. BM Performance ist sicherlich keine schlechte Adresse, wenn es nicht ein "echter" BMW Händler sein muss. Aber auch er wird Geld für die Fehlersuche verlangen, was mit dem Verkäufer (vorab) geklärt werden muss.
3. Ich drücke dir die Daumen, dass das schnell wieder wird 
Der 3 Liter Biturbo ist einfach ein Spaßmotor, bei mir hätte er jedoch das Budget gesprengt... Also ist es nur die 2 Liter (auch mit Biturbo) Variante geworden 
P.S.
Lies mal hier nach, da waren wohl die Unterdruckschläuche/Unterdrucksystem zur Wastegateverstellung undicht und die Ursache für den gleichen Fehler
Wieso bm performance und nicht bei dem Händler wo Du das Ding her hast?
Hello Amo97,
Falls das Thema noch aktuell ist, schau dir Mal die injektoren an, ob alle dicht sind und eh nicht in Diesel schwimmen, war bei mir der Fall.
Ansonsten ist die Ansaugbrücke auch sehr verdächtig (Verkokung) detto das AGR-Ventil.